政党喜好影响决策

与早期国关中心与东亚所所处地位的不同，现在台湾的大陆研究系所与研究单位，已经没有以往的显赫地位了。岛内各主要政党很早就在内部纷纷成立或扩充两岸问题的研究单位，如民进党就成立了“中国事务部”。

当前影响台湾目前大陆政策走向的，与其说是研究单位，不如说是个人或是随领导者的党派喜好而定。例如1999年的“两国论”，是现任民进党主席蔡英文的研究计划案；2001年陈水扁提出的“统合论”，则由前“中央研究院”院长李远哲推荐；前“陆委会主委”、台大教授陈明通所提的“中华民国第二共和”的“宪法草案”，也曾被陈水扁当局认真讨论过。

而目前在马英九当局“国安会”担任秘书长、副秘书长及咨询委员的专家，多数由长年与马英九私交良好或其幕僚熟识的台湾政治大学学者担任，且多是从美国知名大学毕业的“知美派”国际关系专家，如苏起、何思因。此外，“知日派”的杨永明，以及在大陆有广厚人脉的政大东亚所博士陈德升，也是马英九在大陆政策上倚重的对象。

电子媒体扮演“太上皇”

要完整了解台湾的大陆政策与大陆研究，就不能不提及媒体的角色，尤其是电子媒体。

许多大陆民众都知道台湾的政治光谱分成蓝绿两块，其实台湾的电子媒体也分成蓝绿两块。它们泾渭分明，不但鼓动双方的支持者走向极端，也制约着双方的政治人物及大陆政策。

例如在民进党“执政”八年中，许多民进党的政治人物都曾打算改进民进党的现行大陆政策，但这种努力常常遭到来自泛绿媒体的杯葛，如早期年代MUCH台汪笨湖的《台湾的心声》、三立的《大话新闻》与民视的《头家来开讲》。

它们不但对那些想要改进民进党大陆政策路线的“立委”、官员，动则以“中国X”、“西进X”来蔑称，更鼓动听众罢免这些“立委”、官员。套句大陆行话说，就是“下指导棋”。这使得在陈水扁八年期间，民进党错失许多与大陆改善关系的机会。因为没有政治人物敢与这些媒体、听众说实话，长期下来，不但民进党的“执政”基础越来越薄弱，而且路线也越来越极端，最后的结果当然是2008年“立委”选举及“大选”的惨败。