马英九520就职演说备受关注，由于中共总书记胡锦涛日前与国民党荣誉主席连战会面时提出“建立互信、搁置争议、求同存异、共创双赢”十六字箴言，马英九日前首度松口表示，对岸既将建立互信提到最重要位置，“（就职演说时）我会回应”。

中央社报道，322胜选后，马英九大幅减少与媒体互动的时间与机会，马萧办公室10日中午特别安排马英九与平面媒体餐叙，虽然马英九事先言明希望不谈严肃话题，但记者仍把握难得机会，连番提问相关议题，不过马英九也紧守分际，不愿透露太多敏感议题。

马英九日前透过办公室发布新闻稿，肯定胡锦涛的谈话是开启两岸关系新页极为重要的方针。马英九10日中午与平面媒体餐叙，被问到相关议题时表示，胡锦涛十六字谈话中求同存异是过去讲过的立场，但对岸改为强调“建立互信”则具有新意，“我会回应”。

记者进一步追问时，马英九不愿多谈。马英九先前也曾透露，就职演说中关于两岸与美中台互动，将以过去出访美日谈话为基调。

对于直航与两岸复谈看法，马英九认为对岸其实也很急于促成，因此相关进程不致拖太晚，只要两岸在建立互信、搁置争议的基础上复谈、协商，很多目标就可达成，若对岸再打压台湾的国际空间或增加两岸协商阻碍，对岸要背负两岸关系倒退的责任。

在谈到人事案议题，马英九表示，宪法明定监察委员“须超出党派之外”，应由社会公正人士及学者专家组成遴选委员会推荐合适人选，再交由总统提名，确保人选公正超然，虽然陈水扁任内也有类似作法，但陈水扁单是提出的委员会成员就遭外界质疑，提名出的监委人选当然无法获得社会认同。

有人主张应将监察、考试并入立法、行政两院走三权分立体系，马英九则认为，台湾有许多不附属行政院的独立机关，考、监两院具有独立机关性质，维持五权体制并不影响整体运作。